中国水稻研究所是一个以水稻为主要研究对象的多学科综合性国家级研究所。1981年6月经国务院批准在杭州建立，1989年10月落成，是建国以来我国一次性投资最大的农业科研机构。现隶属于中国农业科学院和浙江省人民政府双重领导。2003年经科技部等部门批准为非营利性农业科研机构。现任所长为程式华博士。

研究所以应用基础研究和应用研究为主，着重解决稻作生产中的重大科技问题。具有从事水稻群体、个体、组织、细胞、分子等各层次的科研能力。主要任务：

（1）水稻种质资源的收集、保存、评价和种质创新与利用研究；

（2）研究有关提高稻米产量、品质、耐不良环境和经济效益的重大科学技术和理论问题；

（3）组织和协调全国有关水稻重点科技项目和综合发展研究；

（4）开展国内外水稻科学技术交流、合作研究与人员培训工作，编辑出版水稻学术刊物和理论著作。

现内部科研机构设有：国家水稻改良中心、稻作技术研究与发展中心、农业部稻米及制品质量监督检验测试中心、科技信息中心和水稻生物学国家重点实验室，简称为“四个中心、一个实验室”。

研究所现有在职职工761人（含试验场职工486人），其中高中级科技人员147人，博士生导师13人，具有博士学位42人，硕士学位28人。同时还聘请国内外著名科学家担任兼职研究员。

研究所所部位于杭州市区中心。在杭州西南34公里处的富阳市境内拥有一个包括实验室群、实验农场等在内的科学实验基地，占地7400余亩。基地建有科学实验楼、图书信息楼、生物工程楼、水稻种质库、人工气候箱群、温室、访问科学家与进修培训人员宿舍及其它配套设施，总建筑面积为3.5万平方米。实验室中配备有近1200万美元的科研仪器设备。在海南陵水县还建有海南试验中心。

研究所遵循"立足浙江、面向全国、放眼世界"的办所方针，积极承担来自国家、农业部、浙江省、中国农业科学院和国际合作等立项渠道的科研任务。至今，共取得通过省级以上科研成果132项，获奖成果76项次，涵盖了国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科技进步奖三大奖项。1997年、1998年、2000年和2003年分别有成果入选中国十大科技进展和中国十大科技新闻。成果年应用面积在1.5亿亩以上，取得了巨大的社会经济效益。

编辑出版《中国水稻科学》、《Rice Science》、《中国稻米》期刊及大型水稻学术专著；建有中国水稻信息网（www.cnrri.org、www.chinariceinfo.com）。图书馆拥有中外藏书4万余册。

目前研究所正朝着“全国水稻科学研究中心、科技服务中心、国内外学术交流和人员培训中心"的目标而努力。